RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495515.1

HDAC6-235, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-235ENST00000495515 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 AKAP6Q13023 2319 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 PRR32B1ATL7 298 aa14.65□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 MYL12AP19105 171 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 KITLGP21583 273 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 CDKN1AP38936 164 aa14.65□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 SSX6Q7RTT6 188 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-235ENST00000495515 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.65□□□□□ -0.06
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HDAC6-235ENST00000495515 PTH2RP49190 550 aa14.64□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 TMEM80Q96HE8 168 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 CNBD2Q96M20 576 aa14.64□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 JAM3Q9BX67 310 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 FAM206AQ9NX38 181 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.64□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 GGT3PA6NGU5 568 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 ZNF92Q03936 586 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 TP53I3Q53FA7 332 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 SYS1Q8N2H4 156 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 STX19Q8N4C7 294 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 GGHQ92820 318 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 ITFG2Q969R8 447 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 SPSB4Q96A44 273 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 PERPQ96FX8 193 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 REEP6Q96HR9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 FOXC2Q99958 501 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 ST3GAL4Q11206 333 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 SGK3Q96BR1 496 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-235ENST00000495515 DIRC2Q96SL1 478 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-235ENST00000495515 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.62□□□□□ -0.07
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