RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 IGHG1P01857 330 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 QDPRP09417 244 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CCL3P10147 92 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LPAL2Q16609 132 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 DCAF12L2Q5VW00 463 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 FADS6Q8N9I5 356 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR1S1Q8NH92 325 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MEGF11A6BM72 1044 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C5orf63A6NC05 138 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SULT2B1O00204 365 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CSN2P05814 226 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TDGF1P13385 188 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ABOP16442 354 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF43P17038 809 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C4orf46Q504U0 113 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LRRC46Q96FV0 321 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GUCD1Q96NT3 240 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OPN4Q9UHM6 478 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GTI1 187 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GABRA1P14867 456 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 S100A11P31949 105 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 BVESQ8NE79 360 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OXGR1Q96P68 337 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 EXO5Q9H790 373 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA2O43678 99 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 COX6A1P12074 109 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 BDKRB2P30411 391 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CLDN6P56747 220 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CLDN17P56750 224 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 DHODHQ02127 395 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 UNC119Q13432 240 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TMUB2Q71RG4 321 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 COMMD2Q86X83 199 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC39A7Q92504 469 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LDAHQ9H6V9 325 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PROK2Q9HC23 129 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KIF25Q9UIL4 384 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KLK13Q9UKR3 277 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TECTAO75443 2155 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A8MXK9 166 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TP53I11O14683 189 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RP2O75695 350 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RAB3DO95716 219 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 IL11RAQ14626 422 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TAF13Q15543 124 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CHST4Q8NCG5 386 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF98A6NK75 572 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF726A6NNF4 738 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 E9PLN8 166 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 F5H5P2 479 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KCNAB3O43448 404 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GLAP06280 429 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 HSD11B1P28845 292 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms