RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 NANOGP8Q6NSW7 305 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 MITD1Q8WV92 249 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 H3BN98 237 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT5O43286 388 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A7O60669 478 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A5O76082 557 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OXTP01178 125 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR8U9P0C7N5 309 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CD37P11049 281 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TALDO1P37837 337 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R39P59534 338 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0D1P61421 351 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TSC22D1Q15714 1073 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SMUG1Q53HV7 270 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RIMKLAQ8IXN7 391 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR8U1Q8NH10 309 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RGS18Q9NS28 235 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQV1 116 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRF3 423 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRM7 423 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM223A0PJW6 202 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RAD51BO15315 384 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 VAMP5O95183 116 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CATP04040 527 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PFN3P60673 137 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SYCNQ0VAF6 134 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLAQ13239 276 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 HACD1B0YJ81 288 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 BPY2O14599 106 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 NMT2O60551 498 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RAD1O60671 282 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 SLC19A2O60779 497 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 REM1O75628 298 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TGM6O95932 706 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 KLK1P06870 262 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CISD3P0C7P0 127 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR56A5P0C7T3 313 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 GABRG2P18507 467 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 AZU1P20160 251 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CFHR2P36980 270 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 CSKP41240 450 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM205Q6UW68 189 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 OR2L8Q8NGY9 312 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 UBALD1Q8TB05 177 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 TOP1MTQ969P6 601 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 BET1O15155 118 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 KRT34O76011 436 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 APCSP02743 223 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 CARD18P57730 90 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R46P59540 309 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR2B8PP59922 312 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 STK11Q15831 433 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZVH6 145 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 GPR26Q8NDV2 337 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.77□□□□□ -1.65
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