RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 RD3LP0DJH9 198 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PSMB6P28072 239 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 KDELR2P33947 212 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 BTCP35070 178 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 P2RY2P41231 377 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP10-3P60369 221 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 UBE2G2P60604 165 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 MXD1Q05195 221 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 C2orf80Q0P641 193 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 STX4Q12846 297 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF266Q14584 549 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 QPRTQ15274 297 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CCDC14Q49A88 953 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 THEM4Q5T1C6 240 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CEND1Q8N111 149 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 NECAP1Q8NC96 275 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CHST4Q8NCG5 386 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZFP90Q8TF47 636 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 UCN3Q969E3 161 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 FCRL1Q96LA6 429 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 AGMATQ9BSE5 352 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 REEP1Q9H902 201 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.53□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GTI1 187 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CIB4A0PJX0 185 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 A6NDN8 102 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 A8MU10 97 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 K7EMT4 169 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 K7EN84 100 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 XKRYO14609 159 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ITGB1BP1O14713 200 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A7O60669 478 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PTTG1O95997 202 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MYL9P24844 172 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RND2P52198 227 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 APOC4P55056 127 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 STX17P56962 302 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR2B8PP59922 312 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 NDPQ00604 133 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ZNF45Q02386 682 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FZD2Q14332 565 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 NSDHLQ15738 373 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 AHSA2Q719I0 299 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SSX7Q7RTT5 188 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 DOK4Q8TEW6 326 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 LRRC29Q8WV35 223 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FAM151AQ8WW52 585 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ING5Q8WYH8 240 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MARC2Q969Z3 335 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 C16orf74Q96GX8 76 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ZNF75AQ96N20 296 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CLMPQ9H6B4 373 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RMND1Q9NWS8 449 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MARCH5Q9NX47 278 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CFAP43Q8NDM7 1665 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PREX1Q8TCU6 1659 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 LTBP4Q8N2S1 1624 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS12P58397 1594 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RAD50Q92878 1312 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 A0A0A6YYD5 115 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 KMOO15229 486 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLC31A2O15432 143 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 UTS2O95399 124 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RAB3DO95716 219 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3-48P01763 117 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GLAP06280 429 aa3.51□□□□□ -1.85
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