RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 NSMAFQ92636 917 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC58Q96CX6 371 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLITRK2Q9H156 845 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CALML5Q9NZT1 146 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF150Q9ULK6 438 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 AUP1Q9Y679 476 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CACNG2Q9Y698 323 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 E9PBE3 544 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPRY3O43610 288 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPAG7O75391 227 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT75O95678 551 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SHBGP04278 402 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERPINA5P05154 406 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 BCHEP06276 602 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SBK2P0C263 348 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAKP20794 623 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNOP22674 350 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 MPZP25189 248 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 GRPRP30550 384 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRATP43155 626 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC3A1Q07837 685 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PMS2P3Q13401 168 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP8Q14790 479 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 AARDQ4LEZ3 155 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 C16orf87Q6PH81 154 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM123Q8N131 208 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF519Q8TB69 540 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC38A4Q969I6 547 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAAR8Q969N4 342 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TESCQ96BS2 214 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR52E6Q96RD3 313 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TOR3AQ9H497 397 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHCGQ9UBD6 479 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGP01266 2768 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLSCR5A0PG75 271 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 C11orf98E9PRG8 122 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TXNL1O43396 289 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 XRCC3O43542 346 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 NPIPB7O75200 414 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ENTPD5O75356 428 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6A2O95222 327 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANP32DO95626 131 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 FSHBP01225 129 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 HLA-DOBP13765 273 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF250P15622 560 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 LBPP18428 481 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXA5P20719 270 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARRB2P32121 409 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERPINB5P36952 375 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSNK1A1P48729 337 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF81P51508 661 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRISP3P54108 245 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 UCP2P55851 309 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERVS71-1P61550 626 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLP2Q04941 152 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 EGR4Q05215 589 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF154Q13106 437 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms