RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 POM121Q96HA1 1249 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 IL4I1Q96RQ9 567 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 IL19Q9UHD0 177 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 NF1P21359 2839 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GWJ7 208 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 H0YL77 283 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 H2BFMP0C1H6 154 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ITLN1Q8WWA0 313 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 C1orf159Q96HA4 380 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 YIPF3Q9GZM5 350 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TMEM100Q9NV29 134 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 NAV3Q8IVL0 2385 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 A8MV72 311 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MLNRO43193 412 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 APOC1P02654 83 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ALDH3A2P51648 485 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 AVPI1Q5T686 147 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CBR4Q8N4T8 237 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 OR10AD1Q8NGE0 317 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SPSB4Q96A44 273 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SGK3Q96BR1 496 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 OR2V2Q96R30 315 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 NARFLQ9H6Q4 476 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 DCAF16Q9NXF7 216 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 LAMP5Q9UJQ1 280 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 WIPI2Q9Y4P8 454 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CD300LBA8K4G0 201 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CLDN25C9JDP6 229 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 E9PQ18 207 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TBX1O43435 398 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 XRCC2O43543 280 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF1AP19438 455 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 RBMXP38159 391 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MVKQ03426 396 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 PQLC1Q8N2U9 271 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SP140LQ9H930 580 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 COPS3Q9UNS2 423 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GGT3PA6NGU5 568 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PRR32B1ATL7 298 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 F5H5P2 479 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CRLF1O75462 422 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DPB1P04440 258 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LMO4P61968 165 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM57BQ71RH2 274 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 RAB1CQ92928 201 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MEGF10Q96KG7 1140 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SLC29A1Q99808 456 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ADGRL4Q9HBW9 690 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 HAO2Q9NYQ3 351 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ABCA2Q9BZC7 2435 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 RAD23AP54725 363 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SLC3A1Q07837 685 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 KRT77Q7Z794 578 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GID4Q8IVV7 300 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR52H1Q8NGJ2 320 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TIMD4Q96H15 378 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 REEP6Q96HR9 211 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OPA3Q9H6K4 179 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 NIPAL2Q9H841 368 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GCM1Q9NP62 436 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 BRD7Q9NPI1 651 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LRP12Q9Y561 859 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.421e-13■■□□□ 13
ACTB-211ENST00000480301 PSMD9O00233 223 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TGFAP01135 160 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CA6P23280 308 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SRP9P49458 86 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CDH15P55291 814 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CDC42P60953 191 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM3AP98173 230 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MAB21L1Q13394 359 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM166AQ6J272 317 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 DEGS2Q6QHC5 323 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LINC01356Q8N9X3 169 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR56B2PQ8NGI1 322 aa17.68■□□□□ 0.42
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