RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 G3V3Q6 166 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 SULT1C2O00338 296 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 Q8N3U1 123 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 KLK11Q9UBX7 282 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 H3BSH0 61 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SYT7O43581 403 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 MPZP25189 248 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GIFP27352 417 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GDF1P27539 372 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 BDKRB2P30411 391 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NBL1P41271 181 aa4.94□□□□□ -1.62
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