RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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SMKR1-201ENST00000462322 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.24■□□□□ 0.83
SMKR1-201ENST00000462322 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.24■□□□□ 0.83
SMKR1-201ENST00000462322 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.24■□□□□ 0.83
SMKR1-201ENST00000462322 TOR3AQ9H497 397 aa20.24■□□□□ 0.83
SMKR1-201ENST00000462322 KRT84Q9NSB2 600 aa20.24■□□□□ 0.83
SMKR1-201ENST00000462322 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.24■□□□□ 0.83
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SMKR1-201ENST00000462322 OPA3Q9H6K4 179 aa20.2■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.2■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 COL6A5A8TX70 2615 aa20.2■□□□□ 0.82
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SMKR1-201ENST00000462322 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.19■□□□□ 0.82
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SMKR1-201ENST00000462322 SPICQ8N5J4 248 aa20.19■□□□□ 0.82
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SMKR1-201ENST00000462322 KLHL36Q8N4N3 616 aa20.18■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.18■□□□□ 0.82
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SMKR1-201ENST00000462322 BRD7Q9NPI1 651 aa20.18■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 WNK2Q9Y3S1 2297 aa20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 PRKYO43930 277 aa20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 EPHA2P29317 976 aa20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 MDH2P40926 338 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 CD200P41217 278 aa20.17■□□□□ 0.82
SMKR1-201ENST00000462322 MAB21L1Q13394 359 aa20.17■□□□□ 0.82
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