RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 RHOUQ7L0Q8 258 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PLPP7Q8NBV4 271 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 WDFY2Q96P53 400 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM15Q9C019 465 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFA2O43678 99 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RENP00797 406 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 GSK3BP49841 420 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 METTL11BQ5VVY1 283 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NAA40Q86UY6 237 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ARMCX1Q9P291 453 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RNF114Q9Y508 228 aa21.85■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 GMDSO60547 372 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CA6P23280 308 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TPTEP56180 551 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SEC23BQ15437 767 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FANK1Q8TC84 345 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NMNAT3Q96T66 252 aa21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFAB1O14561 156 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ARPC3O15145 178 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ADAM20O43506 726 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV1-69P01742 117 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RFX4Q33E94 735 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 C11orf91Q3C1V1 193 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SIRPDQ9H106 197 aa21.83■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NOTCH1P46531 2555 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 OOEPA6NGQ2 149 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 CD300LBA8K4G0 201 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 C3orf80F5H4A9 247 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 CLPXO76031 633 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SLC6A6P31641 620 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 GGT2P36268 569 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 KRTAP10-3P60369 221 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 OR8B8Q15620 311 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 ASPHD2Q6ICH7 369 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 LDLRAD3Q86YD5 345 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 LINC01006Q8NI28 216 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 UBE2FQ969M7 185 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SMURF1Q9HCE7 757 aa21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 WNK1Q9H4A3 2382 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 M0R135 149 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 GPR137BO60478 399 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 NCK1P16333 377 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 OR4K13Q8NH42 304 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 LHX4Q969G2 390 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SPTSSAQ969W0 71 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF799Q96GE5 643 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 C7orf34Q96L11 122 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 FUZQ9BT04 418 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 OR52D1Q9H346 318 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 KCNG2Q9UJ96 466 aa21.81■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 HLA-DQA2P01906 255 aa21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 COX4I1P13073 169 aa21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 KRT72Q14CN4 511 aa21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SPERTQ8NA61 448 aa21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 OR52J3Q8NH60 311 aa21.8■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV4-59P01825 116 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 IER3P46695 156 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 PROK1P58294 105 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 TAF9Q16594 264 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SCCPDHQ8NBX0 429 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 MAP6Q96JE9 813 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 IFT27Q9BW83 186 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf123Q9NWV4 160 aa21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0U1RQK1 487 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 GGT3PA6NGU5 568 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 DIRAS1O95057 198 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 NOS3P29474 1203 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF92Q03936 586 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 MZT1Q08AG7 82 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 SNAI3Q3KNW1 292 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 BTN2A1Q7KYR7 527 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 PKP2Q99959 881 aa21.78■■□□□ 1.08
PBRM1-218ENST00000458294 RASSF4Q9H2L5 321 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms