RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 OR8U1Q8NH10 309 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRF-209ENST00000438120 B9D1Q9UPM9 204 aa15.52■□□□□ 0.08
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PTPRF-209ENST00000438120 CTXN2P0C2S0 81 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 PDCD1Q15116 288 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NECAP1Q8NC96 275 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NTN4Q9HB63 628 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 KCNIP2Q9NS61 270 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ALS2Q96Q42 1657 aa15.52■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.51■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.51■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 DCTDP32321 178 aa15.5■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 GPR37O15354 613 aa15.5■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 OR5H8P0DN80 308 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.5■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 V9GYS6 101 aa15.49■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 FXYD1O00168 92 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SULT1C4O75897 302 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 LALBAP00709 142 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ABCD3P28288 659 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ASAH1Q13510 395 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 LRFN5Q96NI6 719 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.49■□□□□ 0.07
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