RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT46Q9NQC8 304 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BML4 177 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM10O14672 748 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT7O43581 403 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TTRP02766 147 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 GLB1P16278 677 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF345Q14585 488 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF19Q5T6S3 580 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MOB3CQ70IA8 216 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM234Q8WY98 164 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SPACA5Q96QH8 159 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 GAREM1Q9H706 876 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TIAF1O95411 115 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 VSIG8P0DPA2 414 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HSF1Q00613 529 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PCK2Q16822 640 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PHB2Q99623 299 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM206AQ9NX38 181 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2AT4A6NND4 320 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PLATP00750 562 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKXP51817 358 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1M1Q8NGA1 313 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC46Q96FV0 321 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CNR1P21554 472 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP16P51512 607 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF4P78317 190 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC157Q569K6 752 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF144BQ7Z419 303 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM185AQ8NFB2 350 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MITD1Q8WV92 249 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF21Q9NSA1 209 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KNTC1P50748 2209 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PMP2P02689 132 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BIDP55957 195 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BPIFCQ8NFQ6 507 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP6Q8TBB0 222 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD2Q9UBB5 411 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD11B1P28845 292 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CASRP41180 1078 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AWAT2Q6E213 333 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NICN1Q9BSH3 213 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQM1 296 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNA6P05013 189 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MC2RQ01718 297 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZP4Q12836 540 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 COX15Q7KZN9 410 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB33BQ9H082 229 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST11Q9NPF2 352 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6C76A6NM76 312 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT2B1O00204 365 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 IL2RAP01589 272 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN1LWP04000 364 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 QRFPP83859 136 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MICU1Q9BPX6 476 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms