RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413241.5

HDLBP-205, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-205ENST00000413241 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MARCH7Q9H992 704 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CENPMQ9NSP4 180 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ZNF878C9JN71 531 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 E9PQ18 207 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 FAM20BO75063 409 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 RP2O75695 350 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CLIC3O95833 236 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 GPANK1O95872 356 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MT-ND5P03915 603 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 H2BFMP0C1H6 154 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SBK2P0C263 348 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SLC2A5P22732 501 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MYF6P23409 242 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 STOMP27105 288 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MAGEB1P43366 347 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 TPTEP56180 551 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ISL1P61371 349 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ERVS71-1P61550 626 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CCL8P80075 99 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 PSG4Q00888 419 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 RAB40BQ12829 278 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CDK5R2Q13319 367 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 KRT77Q7Z794 578 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OTOSQ8NHW6 89 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 UBE2FQ969M7 185 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 TMEM186Q96B77 213 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CNBD2Q96M20 576 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 COQ7Q99807 217 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ATF6BQ99941 703 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 COPS4Q9BT78 406 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MROQ9BYG7 248 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR51B6Q9H340 312 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 NIPAL2Q9H841 368 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 STAB1Q9NY15 2570 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DAPL1A0PJW8 107 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 C5orf49A4QMS7 147 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CCDC182A6NF36 153 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 FAM157AC9JC47 383 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 RER1O15258 196 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SELENOFO60613 162 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ZNF254O75437 659 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 IGHV3-13P01766 116 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 KRT8P05787 483 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MSMBP08118 114 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MYL12AP19105 171 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CRYBB2P43320 205 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 RGS6P49758 472 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CXCR4P61073 352 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SCGB2A2Q13296 93 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ZNF774Q6NX45 483 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CORO6Q6QEF8 472 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 USP51Q70EK9 711 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 TIGD4Q8IY51 512 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 STX19Q8N4C7 294 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 OR51F2Q8NH61 342 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 MYDGFQ969H8 173 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-205ENST00000413241 DECR2Q9NUI1 292 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms