RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390400.2

TRBV28-201, Transcript of T cell receptor beta variable 28, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV28, Length 364 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV28-201ENST00000390400 NUDT9Q9BW91 350 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GPR35Q9HC97 309 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 NTMQ9P121 344 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 LRFN1Q9P244 771 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 PRODH2Q9UF12 536 aa6.66□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 A0A0A6YYH2 397 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GGT3PA6NGU5 568 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 A6NJ64 397 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 OR6C76A6NM76 312 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 J3KTA2 159 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 M0R129 80 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ARPC5O15511 151 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 TGOLN2O43493 480 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF432O94892 652 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 KDM4BO94953 1096 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 F10P00742 488 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 OPN1SWP03999 348 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 CLPSP04118 112 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SERPINA7P05543 415 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 C1QTNF9P0C862 333 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 AGAP20933 346 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 MPZP25189 248 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 AQP1P29972 269 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ATP6V1E1P36543 226 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SERPINF1P36955 418 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 KHKP50053 298 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 EMDP50402 254 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ARHGDIBP52566 201 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 UCNP55089 124 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SLC37A1P57057 533 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ACTBP60709 375 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ERVK-25P63136 954 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ACTG1P63261 375 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 DGCR2P98153 550 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 TLE3Q04726 772 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SMCO1Q147U7 214 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 PEA15Q15121 130 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 DCAF10Q5QP82 559 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SMIM19Q96E16 107 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ALG8Q9BVK2 526 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 MMP25Q9NPA2 562 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 ZNF69Q9UC07 566 aa6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRBV28-201ENST00000390400 SPTA1P02549 2419 aa6.65□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 PCSK5Q92824 1860 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 A0A1B0GTI1 187 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 B9A039 149 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 F8VVB4 439 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 F8VWA3 439 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 H7C417 338 aa6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRBV28-201ENST00000390400 FMO6PO60774 539 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms