RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 F5H423 210 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 F8VP50 259 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR7C2O60412 319 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JAK2O60674 1132 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDH16O75309 829 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ECI2O75521 394 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STAMBPO95630 424 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRYBA1P05813 215 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNP1P09430 55 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR4A8P0C604 315 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHV3-43DP0DP04 118 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC2A1P11166 492 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBL4AP11441 157 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU2F1P14859 743 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DTYMKP23919 212 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCAP28676 217 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 P2RX1P51575 399 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAP1BP61224 184 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF7P61962 342 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU2AF1Q16633 256 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL40Q2TBA0 621 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC01620Q4KN68 170 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MOB3BQ86TA1 216 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LHFPL3Q86UP9 236 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00346Q8IVM7 164 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9orf62Q8N4C0 152 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR2V1Q8NHB1 315 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 METTL6Q8TCB7 284 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AP2M1Q96CW1 435 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SDF2Q99470 211 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 P2RY13Q9BPV8 354 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SDF4Q9BRK5 362 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CENPOQ9BU64 300 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHST5Q9GZS9 411 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR52D1Q9H346 318 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRMSQ9H3Y6 488 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPCSQ9HAB8 311 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TREM1Q9NP99 234 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00588Q9Y4M8 146 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KPTNQ9Y664 436 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 V9GY05 133 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UNC13BO14795 1591 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR62O43379 1518 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa-2.6□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIF1BO60333 1816 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C12orf71A8MTZ7 269 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTGES3LE9PB15 166 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 F8WEM9 126 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHST10O43529 356 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCGB1D2O95969 90 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OPN1SWP03999 348 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CSH1P0DML2 217 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CSH2P0DML3 217 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERGP11308 486 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRPS1L1P21108 318 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GJB2P29033 226 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINB3P29508 390 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSD17B2P37059 387 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDKN2CP42773 168 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACADVLP49748 655 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CETN1Q12798 172 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POSTNQ15063 836 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TGFBIQ15582 683 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSG3Q16557 428 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MPPE1Q53F39 396 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HECTD3Q5T447 861 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF773Q6PK81 442 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CES3Q6UWW8 571 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM131AQ6UXB0 335 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIER3Q7Z3K6 550 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HORMAD1Q86X24 394 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRLF3Q8IUI8 442 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MSRB3Q8IXL7 192 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXT2Q93063 718 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLYATL1Q969I3 302 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HVCN1Q96D96 273 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSSK3Q96PN8 268 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCNAQ96QF7 691 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHCHD7Q9BUK0 85 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KATNB1Q9BVA0 655 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACAT2Q9BWD1 397 aa-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms