RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 CCL13Q99616 98 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 AURKCQ9UQB9 309 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 MED31Q9Y3C7 131 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 GRPP07492 148 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 BMXP51813 675 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 TAS2R41P59536 307 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 ECH1Q13011 328 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 AANATQ16613 207 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 WDR38Q5JTN6 314 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 COQ7Q99807 217 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 SLC22A4Q9H015 551 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM4-201ENST00000307106 LCE6AA0A183 80 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 NDUFB3O43676 98 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 GMDSO60547 372 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LHBP01229 141 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CTLA4P16410 223 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CD83Q01151 205 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MALLQ13021 153 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 IKZF1Q13422 519 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CYP51A1Q16850 503 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MICBQ29980 383 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PGAP1Q75T13 922 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MICU2Q8IYU8 434 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR51A7Q8NH64 312 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MUC7Q8TAX7 377 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 TAMM41Q96BW9 452 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 AJUBAQ96IF1 538 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR52B2Q96RD2 323 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 RERGLQ9H628 205 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 M0R1W7 72 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR5F1O95221 314 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 IFI30P13284 250 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LMO1P25800 156 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PCK2Q16822 640 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 HCP5Q6MZN7 132 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 GJC3Q8NFK1 279 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PIFOQ8TCI5 191 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 SPDL1Q96EA4 605 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PRSS37A4D1T9 235 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 CD300LBA8K4G0 201 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 XKRYO14609 159 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 ACOT8O14734 319 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 ANGPTL7O43827 346 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 AHCYL1O43865 530 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 SLC16A7O60669 478 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LCATP04180 440 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 ACSM4P0C7M7 580 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 STX1BP61266 288 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 HIST1H3AP68431 136 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 BLMHQ13867 455 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms