RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PRU2 124 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HSPB2A8KAH6 182 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PHOX2AO14813 284 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HLA-DQA2P01906 255 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PRH1P02810 166 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HCKP08631 526 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CXCL1P09341 107 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GNB3P16520 340 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 HSPB2Q16082 182 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MEP1BQ16820 701 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 RNF186Q9NXI6 227 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 CCL26Q9Y258 94 aa6.46□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 SMCO3A2RU48 225 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 MEGF11A6BM72 1044 aa6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 UCP2P55851 309 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CLDN6P56747 220 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM33P57088 247 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ALG10Q5BKT4 473 aa6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF550Q7Z398 422 aa6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 NELFAQ9H3P2 528 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CUTCQ9NTM9 273 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 GPR132Q9UNW8 380 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 A8MWP6 167 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CYB5BO43169 146 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 LATO43561 262 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CYTIPO60759 359 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 RENP00797 406 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 QDPRP09417 244 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 DANCRP0C864 163 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 PAX1P15863 534 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.46□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 OR5R1Q8NH85 324 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 PTX4Q96A99 478 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 WDR92Q96MX6 357 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 OR8B4Q96RC9 309 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ATG101Q9BSB4 218 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.46□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.45□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 HEXBP07686 556 aa6.45□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF708P17019 499 aa6.45□□□□□ -1.38
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