RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 PTGER4P35408 488 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 LPAL2Q16609 132 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TVP23CQ96ET8 276 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ASB16Q96NS5 453 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TUSC2O75896 110 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MED9Q9NWA0 146 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 C7orf66A4D0T2 115 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 HSPB6O14558 160 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 CTAG2O75638 210 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 PNLIPRP2P54317 469 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 GCNT2Q8N0V5 402 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ALG14Q96F25 216 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 QDPRP09417 244 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 CXCL3P19876 107 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SELENOPP49908 381 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FAM53BQ14153 422 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM18Q96B42 140 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OR51B6Q9H340 312 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 GPR173Q9NS66 373 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SCN9AQ15858 1988 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 RAB27BO00194 218 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FFAR1O14842 300 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 NQO2P16083 231 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 GUK1Q16774 197 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FAM209AQ5JX71 171 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF439Q8NDP4 499 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 PRRX2Q99811 253 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 CEACAM5P06731 702 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 PTHLHP12272 177 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SNCAP37840 140 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 CARD18P57730 90 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MORN4Q8NDC4 146 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OR4A16Q8NH70 328 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SPACA5Q96QH8 159 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 HSD17B6O14756 317 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OGG1O15527 345 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ALOX12BO75342 701 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 KCNJ3P48549 501 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 DHODHQ02127 395 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 HGDQ93099 445 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TXN2Q99757 166 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SCN1AP35498 2009 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 WNT11O96014 354 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 IGHEP01854 428 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 FABP1P07148 127 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MEOX2P50222 304 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 PIGPP57054 158 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM123Q8N131 208 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OR4S1Q8NGB4 309 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MITD1Q8WV92 249 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MVB12AQ96EY5 273 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 F6UZH7 168 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ICOSLGO75144 302 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MPC2O95563 127 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SEMG1P04279 462 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 C10orf111Q8N326 155 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 ABHD5Q8WTS1 349 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 GNG12Q9UBI6 72 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXA13-201ENST00000222753 POM121BA6NF01 834 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 FRG2CA6NGY1 282 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 M0R135 149 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ST6GAL1P15907 406 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 PLA1AQ53H76 456 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 WDR38Q5JTN6 314 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR2T2Q6IF00 324 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 RXFP4Q8TDU9 374 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 LHX4Q969G2 390 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF799Q96GE5 643 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 GPR137Q96N19 417 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 MMP25Q9NPA2 562 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 GP1BAP07359 652 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ELLP55199 621 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms