RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 DOC2BQ14184 412 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 C4orf17Q53FE4 359 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SVBPQ8N300 66 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TEX29Q8N6K0 151 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FZR1Q9UM11 496 aa9.54□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 GNG3P63215 75 aa9.53□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ALG1L2C9J202 215 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 M0R1X1 148 aa9.53□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 OR4C3Q8NH37 302 aa9.53□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 CMC2Q9NRP2 79 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 HSPB2A8KAH6 182 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 GFRA3O60609 400 aa9.52□□□□□ -0.89
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