RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 LCN10Q6JVE6 187 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 SPATC1Q76KD6 591 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 FCRLAQ7L513 359 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 KRT74Q7RTS7 529 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 NOXA1Q86UR1 476 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ASB5Q8WWX0 329 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 UPRTQ96BW1 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 GFI1Q99684 422 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 MMP28Q9H239 520 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 EMC7Q9NPA0 242 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 TCFL5Q9UL49 500 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 ALG5Q9Y673 324 aa6.4□□□□□ -1.38
CASC19-232ENST00000641480 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.4□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 POLQO75417 2590 aa6.4□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SDK2Q58EX2 2172 aa6.4□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 A0A1B0GUH1 482 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 GGT3PA6NGU5 568 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 H7C417 338 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PSMD9O00233 223 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 EFNA2O43921 213 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PEX14O75381 377 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ALX3O95076 343 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 BPNT1O95861 308 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TGM6O95932 706 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 C1QBP02746 253 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 IL5P05113 134 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 UBBP0CG47 229 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 HLA-DOBP13765 273 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ADRA2CP18825 462 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MSR1P21757 451 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 CCL1P22362 96 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 BTCP35070 178 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SOX2P48431 317 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 CSNK1A1P48729 337 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PTH2RP49190 550 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ZNF84P51523 738 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TAS2R20P59543 309 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 RAC3P60763 192 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 DGCR2P98153 550 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ESPL1Q14674 2120 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 KCNJ8Q15842 424 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 NRN1LQ496H8 165 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 RAET1LQ5VY80 246 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PGAP1Q75T13 922 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SIAH3Q8IW03 269 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TMEM54Q969K7 222 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 HYLS1Q96M11 299 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 AMELYQ99218 206 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MED28Q9H204 178 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 FAM206AQ9NX38 181 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MED29Q9NX70 200 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 GLTPQ9NZD2 209 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.39□□□□□ -1.39
CASC19-232ENST00000641480 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms