RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636093.1

U6.111-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.111-201ENST00000636093 H3BTX0 84 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 C19orf84I3L1E1 186 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 M0R378 163 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CXCL13O43927 109 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SEMA3DO95025 777 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LRATO95237 230 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 GH1P01241 217 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 IGKV1D-33P01593 117 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 IGKV1-33P01594 117 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CD36P16671 472 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 COX5AP20674 150 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SERPINB5P36952 375 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MAGEA4P43358 317 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 PKNOX1P55347 436 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SLC38A11Q08AI6 406 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 STK4Q13043 487 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CHIT1Q13231 466 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CHI3L2Q15782 390 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 HYAL4Q2M3T9 481 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 IQUBQ8NA54 791 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 OR8B12Q8NGG6 310 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 UBE2WQ96B02 151 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MED8Q96G25 268 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SLC30A2Q9BRI3 323 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CWH43Q9H720 699 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 C8orf4Q9NR00 106 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 GLS2Q9UI32 602 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ANAPC7Q9UJX3 599 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LCTP09848 1927 aa-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 UBN2Q6ZU65 1347 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 WASHC1A8K0Z3 465 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ZBTB14O43829 449 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 OR2T1O43869 369 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SERPINB7O75635 380 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MT-CO2P00403 227 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 GSTT2P0CG29 244 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 GSTT2BP0CG30 244 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RAB3AP20336 220 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CCL11P51671 97 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 TNFRSF17Q02223 184 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CYP24A1Q07973 514 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 NME3Q13232 169 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 PNOCQ13519 176 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 TATDN3Q17R31 274 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 C10orf120Q5SQS8 335 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ERMARDQ5T6L9 678 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SPATA1Q5VX52 437 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 FAM71F2Q6NXP2 309 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ENPP6Q6UWR7 440 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 DOLPP1Q86YN1 238 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 NKAIN4Q8IVV8 208 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ACOT4Q8N9L9 421 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 OR2K2Q8NGT1 345 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 OR6K6Q8NGW6 343 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CORO2AQ92828 525 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 TAMM41Q96BW9 452 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ZBTB18Q99592 522 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LRRN3Q9H3W5 708 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RDH14Q9HBH5 336 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 VPREB3Q9UKI3 123 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 FAM169AQ9Y6X4 670 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-2.67□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MROH7Q68CQ1 1323 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MUC4Q99102 2169 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 B4E171 279 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 L7N2F9 121 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 MT-ND4P03905 459 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 C8orf89P0DMQ9 161 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ETS1P14921 441 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CTLA4P16410 223 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 DRD5P21918 477 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 CEACAM3P40198 252 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 RCAN2Q14206 197 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LYG2Q86SG7 212 aa-2.68□□□□□ -2.84
U6.111-201ENST00000636093 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms