RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC3Q9P0I2 261 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 RCE1Q9Y256 329 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOFO60613 162 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1C4O75897 302 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ALOX5APP20292 161 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GADD45AP24522 165 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 EGR3Q06889 387 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC58Q4VC31 144 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TSC22D3Q99576 134 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TACSTD2P09758 323 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CSF3P09919 207 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRA5P31644 462 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.85■□□□□ 0.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 SNX33Q8WV41 574 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 STUB1Q9UNE7 303 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPP2O43688 288 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SRD5A1P18405 259 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 LSAMPQ13449 338 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRAM1Q15629 374 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM120AOSQ5T036 256 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOSQ8NHW6 89 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM54Q969K7 222 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX5Q99593 518 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNG2Q9UJ96 466 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 OGG1O15527 345 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF432O94892 652 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LALBAP00709 142 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TGM4P49221 684 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 GZMKP49863 264 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 KLBQ86Z14 1044 aa20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf36Q96KX1 117 aa20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SSR3Q9UNL2 185 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS3Q9UNS2 423 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPW3 197 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR171O14626 319 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 NR4A2P43354 598 aa20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN17P56750 224 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 OR12D2P58182 307 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ROM1Q03395 351 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 USP43Q70EL4 1123 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SSX6Q7RTT6 188 aa20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM123Q8N131 208 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2M2Q96R28 347 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX7Q9BT81 388 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51E2Q9H255 320 aa20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TENM1Q9UKZ4 2725 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL15A6NJ78 407 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QLW9 94 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX5O75715 221 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DPB1P04440 258 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF19P17023 458 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LAP3P28838 519 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 HCCSP53701 268 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SPCS2Q15005 226 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf128Q5T292 105 aa20.81■□□□□ 0.92
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