RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBL3O95164 117 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSKH1P11801 424 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABOP16442 354 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF20P17024 532 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 HOXC12P31275 282 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP5CP53041 499 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ODF4Q2M2E3 257 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DOK3Q7L591 496 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF627Q7L945 461 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR10A2Q9H208 303 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM206AQ9NX38 181 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 MALT1Q9UDY8 824 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 V9GY05 133 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 M0R135 149 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 TGM6O95932 706 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNPP00491 289 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL2RAP01589 272 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPOP07202 933 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 COX5BP10606 129 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 GNALP38405 381 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 HTR5AP47898 357 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 INSL4Q14641 139 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF799Q96GE5 643 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 CMTM3Q96MX0 182 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 C12orf49Q9H741 205 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLEQ07864 2286 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1W2PPK0 400 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM25AB3EWG3 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM25CB3EWG5 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM25GB3EWG6 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 F5H5K5 113 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRRG2O14669 202 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGHV3-9P01782 118 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FREM3P0C091 2139 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF32P17041 273 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ETV6P41212 452 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCAND1P57086 179 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM57BQ71RH2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGAP1Q75T13 922 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXO17Q96EF6 278 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGCCQ9H4X1 137 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A0U1RQV5 110 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 P2RY10O00398 339 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAGEB3O15480 346 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBX1O43435 398 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 INHBBP09529 407 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FSTP19883 344 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 NTF4P34130 210 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 SKA3Q8IX90 412 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASB5Q8WWX0 329 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms