RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SRRM5B3KS81 715 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R3DO95685 299 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PSMB10P40306 273 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS12P56730 875 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFB3P59826 476 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP77Q6ZQR2 320 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC16Q969W1 377 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf34Q96L11 122 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 FUZQ9BT04 418 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NOTCH1P46531 2555 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 C22orf46C9J442 243 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 F5H5K5 113 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 CD200P41217 278 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 RAD23AP54725 363 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ECH1Q13011 328 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 GPR157Q5UAW9 335 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 OR11L1Q8NGX0 322 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PITX2Q99697 317 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GUS0 222 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFAB1O14561 156 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ENSAO43768 121 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 FAM20BO75063 409 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 RFX4Q33E94 735 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NAA40Q86UY6 237 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00346Q8IVM7 164 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO4A1Q96BD0 722 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NMNAT3Q96T66 252 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ATF6BQ99941 703 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NOX4Q9NPH5 578 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.73■□□□□ 0.91
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PTPRF-216ENST00000617451 ARPC3O15145 178 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 DIRAS1O95057 198 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 MALLQ13021 153 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 MPPED2Q15777 294 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SLC36A3Q495N2 470 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 Q6YL49 198 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 OR52J3Q8NH60 311 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 FANK1Q8TC84 345 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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PTPRF-216ENST00000617451 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 RENP00797 406 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 LCATP04180 440 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 GGT2P36268 569 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 NPY4RP50391 375 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 OCLNQ16625 522 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 PGAP1Q75T13 922 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 OR4F5Q8NH21 305 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 OR4K13Q8NH42 304 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH7Q9H992 704 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 BEX1Q9HBH7 125 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRF-216ENST00000617451 KNG1P01042 644 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A6P31641 620 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 KIR3DL3Q8N743 410 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 PCGF1Q9BSM1 259 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 OR52D1Q9H346 318 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF19Q9NS68 423 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 RNF7Q9UBF6 113 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 CTSZQ9UBR2 303 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC22O60826 627 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 CRYBA1P05813 215 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 SFTPBP07988 381 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 CA6P23280 308 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 CFHR2P36980 270 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT2P50583 147 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 RAG2P55895 527 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 RELBQ01201 579 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 KRT72Q14CN4 511 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRF-216ENST00000617451 OR8G1Q15617 311 aa20.69■□□□□ 0.9
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