RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RAET1LQ5VY80 246 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DEF8Q6ZN54 512 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PIGXQ8TBF5 258 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 GPR148Q8TDV2 347 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 UPRTQ96BW1 309 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CMBLQ96DG6 245 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TECTBQ96PL2 329 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 FEVQ99581 238 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 C1orf198Q9H425 327 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PRODH2Q9UF12 536 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RAB22AQ9UL26 194 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 NPTNQ9Y639 398 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 K7EQS6 105 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ORC5O43913 435 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 GNG7O60262 68 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF10O60809 474 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CLEC3AO75596 197 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 FOLR1P15328 257 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CHRNB4P30926 498 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CASRP41180 1078 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 WASP42768 502 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TNFRSF4P43489 277 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR1E2P47887 323 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ASCL1P50553 236 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CKS1BP61024 79 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RUNX2Q13950 521 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 KHDC3LQ587J8 217 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 YAF2Q8IY57 180 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 UBE2FQ969M7 185 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RGMAQ96B86 450 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SMIM10Q96HG1 83 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 MYADMQ96S97 322 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 HRH4Q9H3N8 390 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ACER3Q9NUN7 267 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 V9GYS6 101 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 A0A0A6YYD5 115 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GW55 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 G3V3Q6 166 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 NDUFS4O43181 175 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TMPRSS11DO60235 418 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SYPP08247 313 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR10J4P0C629 311 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OSMP13725 252 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 AREGP15514 252 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 UGT2B7P16662 529 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CD27P26842 260 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RAB28P51157 221 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 CXADRP78310 365 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 ZIC1Q15915 447 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 AMZ1Q400G9 498 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 SLC5A8Q8N695 610 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PIGTQ969N2 578 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TAAR8Q969N4 342 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 KXD1Q9BQD3 176 aa6.83□□□□□ -1.32
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