RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	FEV	Q99581	238 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989		M0R135	149 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	E2F6	O75461	281 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF3	P17036	446 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	POU1F1	P28069	291 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	THBS2	P35442	1172 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	LCN2	P80188	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	FLOT2	Q14254	428 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PGAP1	Q75T13	922 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	MED20	Q9H944	212 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989		F5H5P2	479 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	TCF21	O43680	179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF205	O95201	554 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PNP	P00491	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSKH1	P11801	424 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SELE	P16581	610 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPI1	P17947	270 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENTPD1	P49961	510 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKX	P51817	358 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A1	P53007	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	GK3P	Q14409	553 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A0G2JMP0	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A0X1KG70	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	MLNR	O43193	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	AVP	P01185	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC2A1	P11166	492 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKACG	P22612	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRK5	P34947	590 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAD23A	P54725	363 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	BTG1	P62324	171 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBX1	P83916	185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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