RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHR2P36980 270 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 OMPP47874 163 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFB3P59826 476 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-3P60369 221 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPEQ05469 1076 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 COX10Q12887 443 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 MPPED2Q15777 294 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CGB2Q6NT52 195 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 BRICD5Q6PL45 260 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOUQ7L0Q8 258 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 UFSP2Q9NUQ7 469 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JK05 382 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM4P0C7M7 580 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CD200P41217 278 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM86BQ8N661 226 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11L1Q8NGX0 322 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TECTBQ96PL2 329 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX15Q96SF7 602 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP4Q9Y6X5 453 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 VWFP04275 2813 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPSL1A2RUU4 121 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC12O95881 172 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP9P14780 707 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA40Q86UY6 237 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ERGIC1Q969X5 290 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRQ8 180 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF879B4DU55 563 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CRABP1P29762 137 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA3P51812 740 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 DGCR6Q14129 220 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 FGD3Q5JSP0 725 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 DNM1P34Q6PK57 102 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6V1Q8N148 313 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMCX1Q9P291 453 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H5K5 113 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY10O00398 339 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NME4O00746 187 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTA4O15217 222 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TOX4O94842 621 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3DO95685 299 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NPY4RP50391 375 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC23BQ15437 767 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A10Q8NG04 563 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO4A1Q96BD0 722 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP27Q9H306 513 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 B9D1Q9UPM9 204 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 POMT1Q9Y6A1 747 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PITX2Q99697 317 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF6BQ99941 703 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SMURF1Q9HCE7 757 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC119BA6NIH7 251 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QZ24 198 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NCK1P16333 377 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 CA6P23280 308 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A2P52569 658 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8G1Q15617 311 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 CD276Q5ZPR3 534 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCD3Q6STE5 483 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAP1Q75T13 922 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SSMEM1Q8WWF3 244 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 GATAD2BQ8WXI9 593 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 WDFY2Q96P53 400 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NMNAT3Q96T66 252 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOXLQ9NUZ1 547 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-18Q9QC07 812 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF7Q9UBF6 113 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 AURKCQ9UQB9 309 aa21.24■□□□□ 0.99
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