RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TPK1	Q9H3S4	243 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	AMBN	Q9NP70	447 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		H3BSA7	217 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GNAO1	P09471	354 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	EVX1	P49640	407 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PPOX	P50336	477 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	FAM57B	Q71RH2	274 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	CMBL	Q96DG6	245 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GSX2	Q9BZM3	304 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		21.37	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ARID1A	O14497	2285 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PLSCR5	A0PG75	271 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		H7C417	338 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFS7	O75251	213 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MT-ND5	P03915	603 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR2T7	P0C7T2	308 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	NAT2	P11245	290 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TUBG1	P23258	451 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS12	P56730	875 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MOG	Q16653	247 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR2T27	Q8NH04	317 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PGAM5	Q96HS1	289 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR8B4	Q96RC9	309 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	FOXC2	Q99958	501 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SP140L	Q9H930	580 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		21.36	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PRR32	B1ATL7	298 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-13	P01766	116 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TIGD6	Q17RP2	521 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	USP51	Q70EK9	711 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR5AS1	Q8N127	324 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	NIPAL2	Q9H841	368 aa		21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		H0YJX3	145 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	KRT8	P05787	483 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ACTC1	P68032	377 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ACTA1	P68133	377 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PSG7	Q13046	419 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		Q5PR19	223 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SSX6	Q7RTT6	188 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	LGALS12	Q96DT0	336 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	DAPL1	A0PJW8	107 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV4-39	P01824	125 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ANOS1	P23352	680 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	VHL	P40337	213 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	EGR3	Q06889	387 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR2T2	Q6IF00	324 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PGAP1	Q75T13	922 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TFAP2C	Q92754	450 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OR10A2	Q9H208	303 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		21.33	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	C5orf63	A6NC05	138 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	XRCC2	O43543	280 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	SSX4	O60224	188 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF254	O75437	659 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	RAC2	P15153	192 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ISL1	P61371	349 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ROM1	Q03395	351 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1

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