RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPW3 197 aa28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MPV17P39210 176 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTH2RP49190 550 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPOXP50336 477 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF679Q8IYX0 411 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR160Q9UJ42 338 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R233 179 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOGQ16653 247 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP51Q70EK9 711 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10H4Q8NGA5 316 aa28.37■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBX5Q99593 518 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTTY10Q9BZA0 68 aa28.37■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF254O75437 659 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAI3Q3KNW1 292 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXW12Q6X9E4 464 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SP140LQ9H930 580 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PTTG3PQ9NZH4 202 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAAR3PQ9P1P4 343 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NKPD1Q17RQ9 610 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf52Q5T4I8 152 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 IZUMO2Q6UXV1 221 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A5Q9H3V2 200 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 IKZF2Q9UKS7 526 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RAC2P15153 192 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCTDP32321 178 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5J2P56134 94 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTC1P68032 377 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTA1P68133 377 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG7Q13046 419 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS12Q96DT0 336 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXXC4Q9H2H0 198 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa28.34■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS45Q7RTY3 260 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VHLP40337 213 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA13P48723 471 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52H1Q8NGJ2 320 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FBLIM1Q8WUP2 373 aa28.31■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRD7Q9NPI1 651 aa28.31■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 XRCC2O43543 280 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFS7O75251 213 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT8P05787 483 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIPAP38571 399 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP15P51511 669 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL22Q53GT1 634 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGAP1Q75T13 922 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACBD7Q8N6N7 88 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 SORCS2Q96PQ0 1159 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB1BQ9H0U4 201 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLSCR5A0PG75 271 aa28.29■■■□□ 2.12
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