RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572629.1

MINK1-208, Transcript of misshapen like kinase 1, human

TSL 3

Gene MINK1, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MINK1-208	ENST00000572629	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	AMELY	Q99218	206 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	NCR1	O76036	304 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	HPX	P02790	462 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ANPEP	P15144	967 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	SELE	P16581	610 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	MAGEB1	P43366	347 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	RCN1	Q15293	331 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	CARTPT	Q16568	116 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	RDH5	Q92781	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	SP140L	Q9H930	580 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MINK1-208	ENST00000572629	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SPRY3	O43610	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	GIF	P27352	417 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	HTR1F	P30939	366 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CX3CR1	P49238	355 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CCL8	P80075	99 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	MNT	Q99583	582 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	RTTN	Q86VV8	2226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629		A0A096LNT2	108 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CD55	P08174	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	NR4A2	P43354	598 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	HCCS	P53701	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	TMED1	Q13445	227 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	TRIP10	Q15642	601 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	RFK	Q969G6	155 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	PHYH	O14832	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	XRCC2	O43543	280 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SBK2	P0C263	348 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	SLC2A1	P11166	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ACHE	P22303	614 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	TNFSF4	P23510	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	CRYBB2	P43320	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ROM1	Q03395	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	ZNF92	Q03936	586 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	POU4F2	Q12837	409 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	RIN1	Q13671	783 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629		Q6ZR03	302 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	USP51	Q70EK9	711 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MINK1-208	ENST00000572629	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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