RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.14□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 M0R3H8 397 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PLPP2O43688 288 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GABARAPO95166 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NPPAP01160 153 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IGHG1P01857 330 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FAM157BP0CG42 384 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SMIM6P0DI80 62 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ADRA2CP18825 462 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AHCYP23526 432 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AQP1P29972 269 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RAD52P43351 418 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 IDH3AP50213 366 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MMP15P51511 669 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MMP16P51512 607 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CRYBA2P53672 197 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UCP2P55851 309 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SELENOVP59797 346 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 BPIFB3P59826 476 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ERVS71-1P61550 626 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TSPAN5P62079 268 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ACTG1P63261 375 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CCL8P80075 99 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC36A2Q495M3 483 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UTS2BQ765I0 119 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SNX33Q8WV41 574 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SNAPC3Q92966 411 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MARC2Q969Z3 335 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NABP1Q96AH0 204 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PHF21AQ96BD5 680 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RDH12Q96NR8 316 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 EBF4Q9BQW3 602 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CDH20Q9HBT6 801 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ESM1Q9NQ30 184 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NANSQ9NR45 359 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ARMCX1Q9P291 453 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SPATA2Q9UM82 520 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.13□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 NOTCH1P46531 2555 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C11orf98E9PRG8 122 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TSPAN4O14817 238 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RNF13O43567 381 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 OR6A2O95222 327 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MPZL1O95297 269 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CH25HO95992 272 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 S100A8P05109 93 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CD55P08174 381 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 QDPRP09417 244 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZP3P21754 424 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 WNT5AP41221 380 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GZMMP51124 257 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UGT2B15P54855 530 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 MELKQ14680 651 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 AWAT1Q58HT5 328 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 STX19Q8N4C7 294 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 TSPEARQ8WU66 669 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 ASB10Q8WXI3 467 aa7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PALB2-202ENST00000561514 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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