RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	ARPC3	O15145	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CHST10	O43529	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RDH16	O75452	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CD55	P08174	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SERPINA6	P08185	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF24	P17028	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PGAM1	P18669	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CALB2	P22676	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HPCAL1	P37235	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	EFNA3	P52797	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	COX10	Q12887	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TTL	Q8NG68	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZBTB18	Q99592	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NPAS2	Q99743	824 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	B4GALT2	O60909	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SCGN	O76038	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	STATH	P02808	62 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SERPIND1	P05546	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	UMPS	P11172	480 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CD1E	P15812	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FNTA	P49354	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	BTG2	P78543	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TLE4	Q04727	773 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RAB40B	Q12829	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF154	Q13106	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	BIK	Q13323	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM156	Q8N614	296 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TSLP	Q969D9	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TMOD3-208	ENST00000560725	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMOD3-208	ENST00000560725	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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