RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 RYR3Q15413 4870 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 OOEPA6NGQ2 149 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 DVL1O14640 695 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 ANGPT2O15123 496 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 RER1O15258 196 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 GYPAP02724 150 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 VSIG8P0DPA2 414 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 MALLQ13021 153 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 VMACQ2NL98 169 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 OTPQ5XKR4 325 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 GJC3Q8NFK1 279 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 COQ7Q99807 217 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC22A4Q9H015 551 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 TOR3AQ9H497 397 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 AURKCQ9UQB9 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A1B0GWJ7 208 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 PRSS37A4D1T9 235 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC16A7O60669 478 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 IFNA14P01570 189 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 CTLA4P16410 223 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 OR1E2P47887 323 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 IDH3AP50213 366 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 PRSS12P56730 875 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 NFYCQ13952 458 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC80Q76M96 950 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 Q96M85 177 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF570Q96NI8 536 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A1W2PRD5 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A1W2PRF3 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A1W2PRM7 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NPFFO15130 113 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC9A3P48764 834 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CENPAP49450 140 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PGAP1Q75T13 922 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NRMQ8IXM6 262 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EBF4Q9BQW3 602 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 A6NLC8 198 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CD14P08571 375 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CA6P23280 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EFNB2P52799 333 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CRYBA2P53672 197 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 MESTQ5EB52 335 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR93Q6P2C0 686 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 DPP10Q8N608 796 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 DTX3Q8N9I9 347 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 LZICQ8WZA0 190 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CFHR4Q92496 578 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ITPKCQ96DU7 683 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SYT4Q9H2B2 425 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 MEIOCA2RUB1 952 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 MPIG6BO95866 241 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 LCATP04180 440 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KIR2DS4P43632 304 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC18A1P54219 525 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PHF21AQ96BD5 680 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PRRC1Q96M27 445 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 F5H5K5 113 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 H3BUX3 64 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms