RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 STARD10Q9Y365 291 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 TENM3Q9P273 2699 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ADAM20O43506 726 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 TSPAN9O75954 239 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 OPN1SWP03999 348 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CST2P09228 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 T-ENOLP0DO92 83 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 NR2C1P13056 603 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 KDELR2P33947 212 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 GSK3BP49841 420 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 NPY4RP50391 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 OR8B8Q15620 311 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 LY6EQ16553 131 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 SPATS1Q496A3 300 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF613Q6PF04 617 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC80Q76M96 950 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 PFN4Q8NHR9 129 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 LZICQ8WZA0 190 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ST8SIA4Q92187 359 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 SLC7A6Q92536 515 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 HAVCR1Q96D42 359 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 R3HDM4Q96D70 268 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 SIRPDQ9H106 197 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 EMC7Q9NPA0 242 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CTSZQ9UBR2 303 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 BAG5Q9UL15 447 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-215ENST00000557428 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CENPBD1B2RD01 187 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 K7EIL1 84 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CXCR6O00574 342 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 GYG2O15488 501 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MLNRO43193 412 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SGCEO43556 437 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR10H3O60404 316 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FAM20BO75063 409 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FBXO24O75426 580 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ATP5HO75947 161 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR7A10O76100 309 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 HLA-DPB1P04440 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 LIPFP07098 398 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CD33P20138 364 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MSR1P21757 451 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PMELP40967 661 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RASSF2P50749 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 KLRD1Q13241 179 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 KCNJ8Q15842 424 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUSP7Q16829 419 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FAM27BQ5VT28 67 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OTPQ5XKR4 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 GLYATQ6IB77 296 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RNF148Q8N7C7 305 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR8G5Q8NG78 346 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PTP4A1Q93096 173 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FAM162AQ96A26 154 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TAMM41Q96BW9 452 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TPD52L3Q96J77 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RBP7Q96R05 134 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MMP28Q9H239 520 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf21Q9H246 121 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 WDR76Q9H967 626 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1W2PRX2 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 H3BUX3 64 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 H7C1C5 153 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms