RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 GGA2Q9UJY4 613 aa3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 CACNG2Q9Y698 323 aa3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 NPPAP01160 153 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 GLAP06280 429 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ELK1P19419 428 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 BGNP21810 368 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 HTR2CP28335 458 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 P2RX1P51575 399 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 UCNP55089 124 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 PON2Q15165 354 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 RGNQ15493 299 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ATP6V1FQ16864 119 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 PIGGQ5H8A4 983 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 HES5Q5TA89 166 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ZNF429Q86V71 674 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 SYS1Q8N2H4 156 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 NTAN1Q96AB6 310 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 SGTBQ96EQ0 304 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 RNF170Q96K19 258 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 ZNF681Q96N22 645 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 REEP1Q9H902 201 aa3.53□□□□□ -1.84
USP15-218ENST00000552346 A0A0B4J2E0 115 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SYCE1LA8MT33 242 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 FAM166BA8MTA8 275 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RDH16O75452 317 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZMPSTE24O75844 475 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CTSLP07711 333 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CD3GP09693 182 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF17P17021 662 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF19P17023 458 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PSMC3P17980 439 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LCN1P31025 176 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RAB7AP51149 207 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF136P52737 540 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR2B8PP59922 312 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLC35B1P78383 322 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MECOMQ03112 1051 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DGCR6Q14129 220 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF266Q14584 549 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DAW1Q8N136 415 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LRRC29Q8WV35 223 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HINT2Q9BX68 163 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SYT4Q9H2B2 425 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MED4Q9NPJ6 270 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 STMN3Q9NZ72 180 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 A0A0J9YXV3 536 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RAB19A4D1S5 217 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR6C74A6NCV1 312 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLC16A7O60669 478 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TRAPPC6AO75865 159 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MYL9P24844 172 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MYCNOSP40205 109 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PPICP45877 212 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 KCNJ3P48549 501 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CSNK1A1P48729 337 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HCAR3P49019 387 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TNNC1P63316 161 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GINS1Q14691 196 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PSG3Q16557 428 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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