RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 HCAR1Q9BXC0 346 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 TRIM15Q9C019 465 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 NDE1Q9NXR1 346 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 IL20Q9NYY1 176 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 AUP1Q9Y679 476 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DCTN3O75935 186 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LCATP04180 440 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 HLA-DPB1P04440 258 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF823P16415 610 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ATP6V1B2P21281 511 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CPT2P23786 658 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PYCR1P32322 319 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MAGEA2P43356 314 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 TPTEP56180 551 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PAX2Q02962 417 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PAX8Q06710 450 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MAB21L1Q13394 359 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ESCO2Q56NI9 601 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LINC00471Q8N535 108 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR10S1Q8NGN2 331 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 NTN4Q9HB63 628 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ACTR3BQ9P1U1 418 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 KCNG2Q9UJ96 466 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 NUP50Q9UKX7 468 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 TCRBV5S2A0A599 114 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 TVP23AA6NH52 213 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 FSTL3O95633 263 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PSKH1P11801 424 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ANOS1P23352 680 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CD200P41217 278 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 GATA4P43694 442 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MXRA7P84157 204 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MALLQ13021 153 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 FAM201AQ5SY85 155 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 KLBQ86Z14 1044 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 FITM2Q8N6M3 262 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SLC37A3Q8NCC5 494 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF69Q9UC07 566 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MIOXQ9UGB7 285 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 B2RBV5 119 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 M0R135 149 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CCNB2O95067 398 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 CD80P33681 288 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RAD23AP54725 363 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SNAI3Q3KNW1 292 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF404Q494X3 552 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PGAP1Q75T13 922 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 C1orf87Q8N0U7 546 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR2T4Q8NH00 348 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 Q8TCH9 128 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ERGIC1Q969X5 290 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF799Q96GE5 643 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MRI1Q9BV20 369 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 C5orf63A6NC05 138 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LRRC30A6NM36 301 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RPS2P15880 293 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 MNAT1P51948 309 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 GNB2P62879 340 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 ZNF92Q03936 586 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PCK2Q16822 640 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DOK3Q7L591 496 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 DCXRQ7Z4W1 244 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 LNX2Q8N448 690 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-229ENST00000551936 SPTSSAQ969W0 71 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms