RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf105O95561 183 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 AIFM1O95831 613 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CD200P41217 278 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PMS2P11Q13670 270 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 IHHQ14623 411 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PMS2CLQ68D20 193 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MED25Q71SY5 747 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GPX8Q8TED1 209 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SPSB1Q96BD6 273 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SDSLQ96GA7 329 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 JAM3Q9BX67 310 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CNIH4Q9P003 139 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 UNC119BA6NIH7 251 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HHLA1C9JL84 531 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HCRTR1O43613 425 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 YIF1AO95070 293 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 AOAHP28039 575 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CSRP3P50461 194 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR1D5P58170 312 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PLK5Q496M5 336 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HES3Q5TGS1 186 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC18Q8N456 261 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 APH1AQ96BI3 265 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MRAP2Q96G30 205 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CSTL1Q9H114 145 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y8X5 98 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 H0YGG7 62 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SULT2B1O00204 365 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 XRCC2O43543 280 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CREG1O75629 220 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MYF5P13349 255 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ART1P52961 327 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GPR18Q14330 331 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 BCORP1Q8N888 145 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MCHR1Q99705 422 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 BCHEP06276 602 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 AREGP15514 252 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SELEP16581 610 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PTGER4P35408 488 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MICBQ29980 383 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FAM78BQ5VT40 261 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DDOQ99489 341 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PITX2Q99697 317 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SGPP1Q9BX95 441 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WV62 115 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 K7ESM1 405 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBP04435 133 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALNT1Q00973 533 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HERPUD1Q15011 391 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MUC15Q8N387 334 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf30Q96GV9 206 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf58Q96LI9 332 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 IL17FQ96PD4 163 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 F2RL3Q96RI0 385 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms