RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 C12orf57Q99622 126 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FAM74A7A6NL05 159 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SLC25A12O75746 678 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 KDM4BO94953 1096 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CASRP41180 1078 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 H2BFSP57053 126 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LGALS3BPQ08380 585 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FOXF1Q12946 379 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 KRT77Q7Z794 578 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ST8SIA1Q92185 356 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 RELTQ969Z4 430 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PELI1Q96FA3 418 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 NMNAT3Q96T66 252 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 KLK11Q9UBX7 282 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MLXQ9UH92 298 aa14.67□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PINLYPA6NC86 204 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ATG12O94817 140 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FCER2P06734 321 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CSF1P09603 554 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CNR1P21554 472 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MFAP5Q13361 173 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 HFEQ30201 348 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LIN54Q6MZP7 749 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 RPTNQ6XPR3 784 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMEM234Q8WY98 164 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ST8SIA2Q92186 375 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 RASD2Q96D21 266 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 V9GY05 133 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DNAJC13O75165 2243 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.66□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR5H15A6NDH6 313 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR6C68A6NDL8 312 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 NUDT19A8MXV4 375 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 IMPA2O14732 288 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 RAB13P51153 203 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DEFA5Q01523 94 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SVBPQ8N300 66 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 POC1BQ8TC44 478 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TAAR8Q969N4 342 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 GINS4Q9BRT9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DKK4Q9UBT3 224 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 TMEM72A0PK05 275 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 H7C417 338 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 RLN2P04090 185 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CD14P08571 375 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ZNF35P13682 527 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 IL11P20809 199 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 CXCR1P25024 350 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DIO1P49895 249 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 HCCSP53701 268 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PON3Q15166 354 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ALG10Q5BKT4 473 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MTFR2Q6P444 385 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FCRLAQ7L513 359 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SSX6Q7RTT6 188 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 FAM122BQ7Z309 247 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 MDS2Q8NDY4 140 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms