RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPR2	Q14571	2701 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MED13	Q9UHV7	2174 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM150B	A6NC51	233 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf77	C9JDV5	145 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	B4GALT5	O43286	388 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A5	P22732	501 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RRM2	P31350	389 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RORA	P35398	523 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT1	P36639	197 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVK-25	P63136	954 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PAX5	Q02548	391 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0040	Q15053	153 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HES3	Q5TGS1	186 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC20B	Q86Y33	519 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC34A3	Q8N130	599 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CD177	Q8N6Q3	437 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	STMN2	Q93045	179 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf44	Q96CB5	159 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RARRES2	Q99969	163 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EBF4	Q9BQW3	602 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACBD6	Q9BR61	282 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EHD1	Q9H4M9	534 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FANCE	Q9HB96	536 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LYRM4	Q9HD34	91 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	VNN3	Q9NY84	501 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL26	Q9Y258	94 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SCN1A	P35498	2009 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ESPL1	Q14674	2120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NOTCH2	Q04721	2471 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SIRPB1	O00241	398 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	AIM2	O14862	343 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX15	O60248	233 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HUS1	O60921	280 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLPX	O76031	633 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SNAPIN	O95295	136 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DEXI	O95424	95 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIC3	O95833	236 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV3-19	P01714	112 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GP1BA	P07359	652 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	2.95	□□□□□ -1.94	4e-14	■□□□□ 9.5
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFSF9	P41273	254 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GLP1R	P43220	463 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RY4	P51582	365 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DLX1	P56177	255 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A9	P82251	487 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF45	Q02386	682 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6AP1	Q15904	470 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB6	Q15916	424 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR157	Q5UAW9	335 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR9G1	Q8NH87	305 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C7orf33	Q8WU49	177 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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