RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SPATC1Q76KD6 591 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CYGBQ8WWM9 190 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TFAP2CQ92754 450 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 DOK1Q99704 481 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CHODLQ9H9P2 273 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CENPMQ9NSP4 180 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 FZR1Q9UM11 496 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 C5orf63A6NC05 138 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 F5H5K5 113 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 H0YAE9 185 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 J3QRE1 110 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 APOL3O95236 402 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CSF3P09919 207 aa15.91■□□□□ 0.14
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PUF60-218ENST00000531995 OPRL1P41146 370 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TMED1Q13445 227 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 EFNB3Q15768 340 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 USP51Q70EK9 711 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 THEM6Q8WUY1 208 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 BEX2Q9BXY8 128 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CMAHPQ9Y471 501 aa15.91■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.148e-12■■■□□ 15.7
PUF60-218ENST00000531995 ZNF878C9JN71 531 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MPZL2O60487 215 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ABHD16AO95870 558 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CLPTM1O96005 669 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 LYNP07948 512 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 BMP4P12644 408 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ABHD4Q8TB40 342 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.9■□□□□ 0.14
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PUF60-218ENST00000531995 PLK3Q9H4B4 646 aa15.9■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.9■□□□□ 0.14
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PUF60-218ENST00000531995 MPV17P39210 176 aa15.89■□□□□ 0.13
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PUF60-218ENST00000531995 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CYB5R2Q6BCY4 276 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SSX6Q7RTT6 188 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PIMREGQ9BSJ6 248 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CLN6Q9NWW5 311 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.89■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
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PUF60-218ENST00000531995 M0R135 149 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MTNR1AP48039 350 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 EVX1P49640 407 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PDLIM4P50479 330 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TPTEP56180 551 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IL5RAQ01344 420 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ROM1Q03395 351 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IL18R1Q13478 541 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LRRN1Q6UXK5 716 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RNFT2Q96EX2 444 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF799Q96GE5 643 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SYT3Q9BQG1 590 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 COPS4Q9BT78 406 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 VCXQ9H320 206 aa15.88■□□□□ 0.13
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