RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309		A0A0J9YXV3	536 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	TSPAN11	A1L157	253 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	C7orf66	A4D0T2	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CCNK	O75909	580 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	MPZL1	O95297	269 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	HPRT1	P00492	218 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RAB4A	P20338	218 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	KIR3DL2	P43630	455 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	DGCR6	Q14129	220 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	KIF21B	O75037	1637 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NCOA2	Q15596	1464 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309		A0A1W2PQ67	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309		H0YJW9	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	FCN3	O75636	299 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLC22A5	O76082	557 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLC1A2	P43004	574 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CRADD	P78560	199 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NCF4	Q15080	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BEX5	Q5H9J7	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RNF5	Q99942	180 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NME4	O00746	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RBBP9	O75884	186 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RCBTB2	O95199	551 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CCNE2	O96020	404 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	POLR2M	P0CAP2	368 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RFC3	P40938	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	GFER	P55789	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CDK5	Q00535	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CDC20	Q12834	499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	LY6E	Q16553	131 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	OR10G6	Q8NH81	332 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	DOK1	Q99704	481 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	PIGU	Q9H490	435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	LYRM4	Q9HD34	91 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	WDR97	A6NE52	1622 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	PLPP1	O14494	284 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BCKDK	O14874	412 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CHST10	O43529	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CD74	P04233	296 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	IFNW1	P05000	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	NBL1	P41271	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	RAB7A	P51149	207 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	HORMAD1	Q86X24	394 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	BBOF1	Q8ND07	529 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf198	Q9H425	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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