RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	MAP6	Q96JE9	813 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	YY1AP1	Q9H869	796 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	VNN3	Q9NY84	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ACOT8	O14734	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	E2F6	O75461	281 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	GYPB	P06028	91 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	IRF2	P14316	349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SPI1	P17947	270 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC15A1	P46059	708 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	MMP16	P51512	607 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	FLOT2	Q14254	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA24	Q86W54	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OTULIN	Q96BN8	352 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DDO	Q99489	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	FEV	Q99581	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC22A4	Q9H015	551 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	DYSF	O75923	2080 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393		F5H5P2	479 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393		H0YL77	283 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	GRK5	P34947	590 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	NAA40	Q86UY6	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OPA3	Q9H6K4	179 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	SP140L	Q9H930	580 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	MLNR	O43193	412 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	APOC1	P02654	83 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHA1	P21709	976 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	CPT2	P23786	658 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	POU1F1	P28069	291 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	HSD11B1	P28845	292 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKX	P51817	358 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-215	ENST00000524393	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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