RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518720.5

TSNARE1-202, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-202ENST00000518720 LIMS4P0CW20 117 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ANOS1P23352 680 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PSMB10P40306 273 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR12D2P58182 307 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SLC35A2P78381 396 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PGAM5Q96HS1 289 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 JAM3Q9BX67 310 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LRRC42Q9Y546 428 aa14.77□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DSCAMO60469 2012 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CACNA1DQ01668 2161 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 C5orf63A6NC05 138 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MYL12BO14950 172 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 RGS10O43665 173 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SULT1C4O75897 302 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PRF1P14222 555 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 FABP6P51161 128 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LIPNQ5VXI9 398 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 FAM206AQ9NX38 181 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 STARD10Q9Y365 291 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CMAHPQ9Y471 501 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 R4GMQ9 66 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.76□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ICMTO60725 284 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MT-ND2P03891 347 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TACSTD2P09758 323 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR4A8P0C604 315 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GLRXP35754 106 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PRSS12P56730 875 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MALLQ13021 153 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TIGD6Q17RP2 521 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MSMPQ1L6U9 139 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SYT3Q9BQG1 590 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF649Q9BS31 505 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR10A2Q9H208 303 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SP140LQ9H930 580 aa14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 J3QW42 95 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ATE1O95260 518 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PNPP00491 289 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MT-ND5P03915 603 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GCH1P30793 250 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MPV17P39210 176 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GABARAPL2P60520 117 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ADIPOQQ15848 244 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 COMMD2Q86X83 199 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SYS1Q8N2H4 156 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 RORBQ92753 470 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PELI1Q96FA3 418 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 COG8Q96MW5 612 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DUSP21Q9H596 190 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DUSP13Q9UII6 198 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 A0A1W2PPW3 197 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 VSTM5A8MXK1 200 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 HTR1AP08908 422 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DCTDP32321 178 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KRTAP10-9P60411 292 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ODF4Q2M2E3 257 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF544Q6NX49 715 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms