RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514344.5

CHD1-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 5

Gene CHD1, Length 2,955 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-211	ENST00000514344	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		2.56	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		2.56	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344		A0A1B0GWA3	101 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	VGLL3	A8MV65	326 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ACOT8	O14734	319 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	GLCE	O94923	617 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	BGLAP	P02818	100 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SPARC	P09486	303 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	CA6	P23280	308 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR3A4P	P47883	348 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	NME5	P56597	212 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC34A1	Q06495	639 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LIN52	Q52LA3	116 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	NXN	Q6DKJ4	435 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR5J2	Q8NH18	312 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	PBK	Q96KB5	322 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ATF6B	Q99941	703 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344		A0A1W2PPL8	197 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344		M0R1W7	72 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SAP30	O75446	220 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	BCHE	P06276	602 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	UMPS	P11172	480 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	PRPH2	P23942	346 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SERPINB5	P36952	375 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	MAGEA4	P43358	317 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	MTNR1B	P49286	362 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	POU3F4	P49335	361 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	PRKAA2	P54646	552 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	PCK2	Q16822	640 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	CFAP157	Q5JU67	520 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ERGIC1	Q969X5	290 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	COQ8B	Q96D53	544 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FCRL1	Q96LA6	429 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	NABP2	Q9BQ15	211 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	NUF2	Q9BZD4	464 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344		A0A1B0GVY2	172 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	CH25H	O95992	272 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ARG1	P05089	322 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	AMY2B	P19961	511 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	HTR2A	P28223	471 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	GGT2	P36268	569 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	RAD23A	P54725	363 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR8G1	Q15617	311 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	HIST3H3	Q16695	136 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FAM27B	Q5VT28	67 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	LINC00471	Q8N535	108 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	OR8U1	Q8NH10	309 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	BBS10	Q8TAM1	723 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	EPYC	Q99645	322 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	WAC	Q9BTA9	647 aa		2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CHD1-211	ENST00000514344	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		2.55	□□□□□ -2

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