RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	NID1	P14543	1247 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLIPR1	P48060	266 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP16	P51512	607 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCN6	P62502	163 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	JAG1	P78504	1218 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF92	Q03936	586 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPPE1	Q53F39	396 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM129C	Q86XR2	697 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NECAP1	Q8NC96	275 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF878	C9JN71	531 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HCRTR2	O43614	444 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMBP	P02760	352 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF20	P17024	532 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPP4	P27487	766 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AQP10	Q96PS8	301 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL17C	Q9P0M4	197 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCD	O00767	359 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCAT	P04180	440 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LBX1	P52954	281 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLE3	Q04726	772 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4K15	Q8NH41	348 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	APH1A	Q96BI3	265 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR20	Q99678	358 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPC1	479 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		E5RGE8	158 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CA11	O75493	328 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTAG2	O75638	210 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGSF6	O95976	241 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSTA	P01040	98 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TFPI2	P48307	235 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOB	Q15370	118 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MVB12A	Q96EY5	273 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSG2	Q9Y328	171 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLX4	Q8IY92	1834 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GTI1	187 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DRGX	A6NNA5	263 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BPNT1	O95861	308 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOLR1	P15328	257 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST6GAL1	P15907	406 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ID4	P47928	161 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENOT	P62341	195 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP2CB	P62714	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP2CA	P67775	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDE7A	Q13946	482 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	COMMD2	Q86X83	199 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF563	Q8TA94	476 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PELI1	Q96FA3	418 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRX2	Q99811	253 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51I2	Q9H344	312 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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