RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD4	Q8TB40	342 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMD4	Q96H15	378 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ7	Q99807	217 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX7	Q9BT81	388 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RER1	O15258	196 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD16A	O95870	558 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CLU	P10909	449 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB2A2	Q13296	93 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIP10	Q15642	601 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX30	Q5JUR7	227 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf73	Q69YU5	71 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO6	Q6QEF8	472 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GID4	Q8IVV7	300 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF511	Q8NB15	262 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM163	Q8TC26	289 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB1C	Q92928	201 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTSSA	Q969W0	71 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HAVCR1	Q96D42	359 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	VCX	Q9H320	206 aa		14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN25	C9JDP6	229 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNL4	K9M1U5	179 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-46	P01743	117 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RAC2	P15153	192 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CPT2	P23786	658 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	IL2RG	P31785	369 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GGT2	P36268	569 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC15A1	P46059	708 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5R2	Q13319	367 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	APOF	Q13790	326 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51F2	Q8NH61	342 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RFK	Q969G6	155 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB39B	Q96DA2	213 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RDH12	Q96NR8	316 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF6B	Q99941	703 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51B6	Q9H340	312 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		14.68	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	STAB1	Q9NY15	2570 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A6YYJ9	748 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SNTN	A6NMZ2	147 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF212B	A8MTL3	300 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKY	O43930	277 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NGF	P01138	241 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	APOC1	P02654	83 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MSMB	P08118	114 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MPV17	P39210	176 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TPTE	P56180	551 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG7	Q13046	419 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPN	Q5VXI9	398 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OTP	Q5XKR4	325 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM186	Q96B77	213 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TEAD3	Q99594	435 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TOR3A	Q9H497	397 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR76	Q9H967	626 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		14.67	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MPZL2	O60487	215 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF1A	P19438	455 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF4	P23510	183 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GATA3	P23771	443 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA2	P29317	976 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		14.66	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	USP51	Q70EK9	711 aa		14.66	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms