RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-31P0DP07 118 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PRKXP51817 358 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TAF13Q15543 124 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZMAT1Q5H9K5 638 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 C12orf73Q69YU5 71 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 DRAM2Q6UX65 266 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 USP51Q70EK9 711 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OR5AS1Q8N127 324 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RNF133Q8WVZ7 376 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ENOPH1Q9UHY7 261 aa17.79■□□□□ 0.44
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ACTB-211ENST00000480301 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 LRP5LA4QPB2 252 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 C5orf63A6NC05 138 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CCDC182A6NF36 153 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-211ENST00000480301 SLC6A9P48067 706 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PRSS12P56730 875 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RPS7P62081 194 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 APOFQ13790 326 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SNAI3Q3KNW1 292 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 C10orf67Q8IYJ2 551 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OR8G5Q8NG78 346 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OTOSQ8NHW6 89 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-211ENST00000480301 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 INAFM1C9JVW0 142 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SLC15A1P46059 708 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 GRB2P62993 217 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 MALLQ13021 153 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RHOUQ7L0Q8 258 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZNF454Q8N9F8 522 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ELMOD3Q96FG2 381 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 EGLN1Q9GZT9 426 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 S100A14Q9HCY8 104 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PPIHO43447 177 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 IL2RGP31785 369 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF283Q8N7M2 679 aa17.76■□□□□ 0.43
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ACTB-211ENST00000480301 TMEM163Q8TC26 289 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SOX7Q9BT81 388 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TOR3AQ9H497 397 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 RIBC2Q9H4K1 309 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 USE1Q9NZ43 259 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SONP18583 2426 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 WNT9BO14905 357 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ALPLP05186 524 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 LYNP07948 512 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A1P11166 492 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SELEP16581 610 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 GZMKP49863 264 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ZNF92Q03936 586 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 GLYATL3Q5SZD4 288 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 C6orf52Q5T4I8 152 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 PGAP1Q75T13 922 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 OR2AE1Q8NHA4 323 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 THEM6Q8WUY1 208 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HPS1Q92902 700 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A2Q9BRI3 323 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TREM2Q9NZC2 230 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 EI24O14681 340 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 ALOX5APP20292 161 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF4P23510 183 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HSD11B1P28845 292 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CX3CR1P49238 355 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HCCSP53701 268 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 HFEQ30201 348 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 BHLHE23Q8NDY6 225 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 OR13G1Q8NGZ3 307 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 CCL17Q92583 94 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-211ENST00000480301 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
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