RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472897.5

RBM3-205, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-205	ENST00000472897	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897		A0A1W2PPW3	197 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897		J3QRE1	110 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897		M0R233	179 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SLC6A9	P48067	706 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CX3CR1	P49238	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ATP5J2	P56134	94 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CXCR4	P61073	352 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	IL5RA	Q01344	420 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MALL	Q13021	153 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PSG7	Q13046	419 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	USP51	Q70EK9	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PERP	Q96FX8	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CLIC3	O95833	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MT-ND5	P03915	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ADRA2A	P08913	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SELE	P16581	610 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	EFNA4	P52798	201 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	XRCC2	O43543	280 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MMP15	P51511	669 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	AQP4	P55087	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ACTC1	P68032	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ACTA1	P68133	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RAB40B	Q12829	278 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	NDUFS7	O75251	213 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SULT1C4	O75897	302 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	APOL3	O95236	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	GNAO1	P09471	354 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SLC2A1	P11166	492 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MMP16	P51512	607 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-205	ENST00000472897	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26

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