RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 FPR3P25089 353 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HIST1H3AP68431 136 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SLC35A2P78381 396 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRR20EP86478 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRR20CP86479 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRR20DP86480 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRR20BP86481 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRR20AP86496 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DOC2BQ14184 412 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DTX3Q8N9I9 347 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 MUC7Q8TAX7 377 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB18Q99592 522 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SSX3Q99909 188 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RMND5AQ9H871 391 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RAB18Q9NP72 206 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 EMC7Q9NPA0 242 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM100Q9NV29 134 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DUX4Q9UBX2 424 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RAB21Q9UL25 225 aa8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 E9PQ18 207 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ZFPL1O95159 310 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ANP32DO95626 131 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 IRF2P14316 349 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 IDO1P14902 403 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 AMY2BP19961 511 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 CD247P20963 164 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 CRYBA2P53672 197 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 AQP6Q13520 282 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SCARB2Q14108 478 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 LAPTM4AQ15012 233 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 IFT20Q8IY31 132 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PFN4Q8NHR9 129 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 MAP6Q96JE9 813 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RBP7Q96R05 134 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DDOQ99489 341 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 CENPHQ9H3R5 247 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PNPOQ9NVS9 261 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 MEIOCA2RUB1 952 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 VGLL3A8MV65 326 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 FBP2O00757 339 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 BIRC5O15392 142 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SERPINB7O75635 380 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 GYPAP02724 150 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 UMPSP11172 480 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 FAHP16930 419 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SLC1A6P48664 564 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 VSNL1P62760 191 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 LY6EQ16553 131 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 SMYD1Q8NB12 490 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.31□□□□□ -1.08
LAMC1-202ENST00000466964 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms