RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 SHFQ7M4L6 423 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 LGI4Q8N135 537 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ASB15Q8WXK1 588 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 Q96MT0 163 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2V2Q96R30 315 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SORT1Q99523 831 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 NICN1Q9BSH3 213 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RHOFQ9HBH0 211 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ADA2Q9NZK5 511 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RHCGQ9UBD6 479 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DUX4Q9UBX2 424 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 NPTNQ9Y639 398 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 JMJD1CQ15652 2540 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 NINQ8N4C6 2090 aa6.51□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HCFC1P51610 2035 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 E9PLN8 166 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 GOSR2O14653 212 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 AZIN1O14977 448 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PCDH7O60245 1069 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SELENOFO60613 162 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CDC14BO60729 498 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2C1O95371 312 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 IGKV3-11P04433 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 KLK1P06870 262 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HTR1AP08908 422 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPINA2P20848 420 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C4BPBP20851 252 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 UQCRC2P22695 453 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PRPH2P23942 346 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CEACAM3P40198 252 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB9AP51151 201 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZP1P60852 638 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAM8P78325 824 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TFF3Q07654 80 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RAET1LQ5VY80 246 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SIAH3Q8IW03 269 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 BEST3Q8N1M1 668 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 FADS6Q8N9I5 356 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MDS2Q8NDY4 140 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2T11Q8NH01 316 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 COQ8AQ8NI60 647 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFP90Q8TF47 636 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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RPUSD3-212ENST00000466141 SMPDL3BQ92485 455 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 UCN3Q969E3 161 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 FCRL1Q96LA6 429 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 JAM3Q9BX67 310 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 EBPLQ9BY08 206 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10A5Q9H207 317 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR173Q9NS66 373 aa6.5□□□□□ -1.37
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