RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SNTNA6NMZ2 147 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SPARCP09486 303 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CD40LGP29965 261 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 GALK2Q01415 458 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ECH1Q13011 328 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP37Q8NFH4 326 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 RFKQ969G6 155 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ7Q99807 217 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DLL4Q9NR61 685 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6C6A6NF89 314 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 VSTM5A8MXK1 200 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNGR3O43761 229 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 NR4A1P22736 598 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR5AP47898 357 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 GGTLC2Q14390 218 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 OCLNQ16625 522 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF611Q8N823 705 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2FQ969M7 185 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXW5Q969U6 566 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 Q96MT0 163 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 NEK6Q9HC98 313 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCA4P78363 2273 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 C5orf49A4QMS7 147 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 E7EQL1 145 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 BMP4P12644 408 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL2P13500 99 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNOP22674 350 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR1FP30939 366 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD52P43351 418 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP5CP53041 499 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 HGFACQ04756 655 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 IL18R1Q13478 541 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP78Q5JTW2 689 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL9Q6T311 187 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SETD9Q8NE22 299 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 NEUROG1Q92886 237 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP6Q96JE9 813 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPR3Q14573 2671 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-205ENST00000450873 SELENOFO60613 162 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT8P05787 483 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRB1P18505 474 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT6P53370 316 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 POU4F2Q12837 409 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF691Q5VV52 312 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF544Q6NX49 715 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ATF6BQ99941 703 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CLN6Q9NWW5 311 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 CADP27708 2225 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM25AB3EWG3 89 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms